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《玉米品种纯度鉴定:InDel分子标记法》团体标准发布
玉米品种 纯度鉴定 InDel分子标记法 团体标准
2023/11/24
2023年6月1日,中国作物学会发布了团体标准《玉米品种纯度鉴定:InDel分子标记法》(T/CROPSSC 002-2023),这是中国作物学会组织制定的首个涉及分子鉴定方法的团体标准,将对我国玉米品种生产、加工及鉴定产生重要影响。
基于高通量测序的大麦InDel标记开发及应用
大麦 重测序 InDel标记 品种鉴定
2020/12/31
分子标记是遗传研究的基础工具, 广泛应用于遗传多样性研究、种质鉴定、遗传图谱构建和基因定位等领域。本研究基于大麦的全基因组重测序数据鉴定出的二态性SNP位点, 开发出遍布全基因组的118对InDel引物。以49份不同地理来源的大麦种质检测其有效性, 筛选出2个等位基因的共显性InDel标记72对, 进一步对288份大麦种质进行遗传距离分析及构建系统发育树。结果显示, 筛选到32个有效性的核心InD...
InDel Marker Based Estimation of Multi-Gene Allele Contribution and Genetic Variations for Grain Size and Weight in Rice (Oryza sativa L.)
Insertion/Deletion (InDel) markers genetic variation multi-gene allele contributions rice (Oryza sativa L.), grain size and weight rice germplasm
2023/8/9
The market success of any rice cultivar is exceedingly dependent on its grain appearance, as well as its grain yield, which define its demand by consumers as well as growers. The present study was und...
花生栽培种InDel有效标记筛选与评估
花生 InDeI标记 多态性
2020/3/2
为获得花生栽培种中有效的InDel标记,本研究基于花生简化基因组检测到的InDel信息,经PCR扩增以及电泳检测验证引物的有效性与多态性,利用生物统计学软件检测InDel标记的多态性水平。结果表明,在花生基因组上设计的39对引物在覆盖4个植物学类型的21份花生中均可获得扩增产物,其中14对引物具有多态性,为总引物数的35.9%,有3对引物位于基因编码区;Shannon指数为0.191 4~1.29...
西瓜枯萎病生理小种1抗性QTL精细定位与InDel标记开发
西瓜 枯萎病生理小种1 QTL精细定位 InDel标记
2017/11/24
通过QTL初定位检测栽培西瓜枯萎病生理小种1抗性的主效QTL,验证枯萎病抗性基因Fon-1的存在,结合亲本重测序信息开发紧密连锁易于检测的InDel (insertion/deletion)分子标记,为西瓜枯萎病分子标记辅助育种提供技术支撑,并实现该QTL的精细定位,加速Fon-1的克隆和功能验证进程。【方法】以高抗枯萎病的栽培西瓜‘ZXG01478’和高感病的栽培西瓜‘14CB11’为亲本构建的...
利用InDel标记鉴定水稻育种材料的籼粳属性
InDel 分子标记 籼粳鉴定 水稻
2013/9/3
准确高效鉴定水稻材料的籼粳属性对于开展水稻籼粳亚种间杂种优势利用有着重要意义。利用19对基于籼稻(9311)和粳稻(日本晴)全基因组DNA序列比对获得的差异片段而设计的特异插入/缺失(Insertion/Deletion,InDel)引物,对48份育种上常用的籼稻、粳稻和中间型材料(品种)进行了InDel标记的籼粳属性分析,利用DNA样品在这19对InDel位点上的籼型或粳型基因频率,结合聚类分析...
Genetic Relationships of Sorghum Germplasm in Asia and Africa Revealed by Rice cDNA-STS and Indel Markers
genetic diversity grain sorghum
2010/10/25
The elucidation of Sorghum bicolor intraspecific genetic diversity is of interest in studies on evolutionary forces under domestication and geographical distribution, and has application in the design...